Summary of genome analysis for Caenorhabditis elegans

Page 7 of 41

1  2  3  4  5  6  7 8  9  10  11  12  13  14  15  16  17  18  19  20 
21  22  23  24  25  26  27  28  29  30  31  32  33  34  35  36  37  38  39  40 
41 
ID seqLen membrane helix signal peptide coils SEG blast EUCLID
nHtmtopohtmReg nCoilsaaInCoilscoilsReg aaInSegsegReg nAlignnAlignPdbaaInPdbpdbReg
ce085674930  2600 106-1521757846628-493Energy metabolism
ce278186170  000 2436-40, 48-57, 277-285165236693-97, 100-119, 125-173, 176-200, 332-343, 345-535, 538-601Regulatory functions
ce015094720  029019-53, 55-10913179-1911400 Regulatory functions
ce030566790  039813-47, 197-231, 267-294313-13, 530-538, 568-578400 Unknown
ce021563820  000 12167-178395730872-379Cellular processes
ce015121370  000 1035-44100 Unknown
ce015132680  000 153-172090122421-242Transport and binding proteins
ce015143920  000 0 88123113-31, 35-41, 43-95, 103-146, 149-187, 189-198, 202-260Unknown
ce015152040  000 26172-186, 194-204100 Unknown
ce030572370  000 0 111213687-92, 94-143, 155-205, 208-236Cellular processes
ce030493057in62-80, 97-117, 129-150, 155-172, 184-203, 229-250, 272-289000 274-16, 100-1134100 Unknown
ce030508211out725-7422200 6610-24, 461-475, 499-524, 800-809400 Unknown
ce030515350  000 22499-520169163153-201, 205-218Energy metabolism
ce030525990  000 0 176955828-585Energy metabolism
ce030534730  000 0 8500 Unknown
ce030545020  000 2330-43, 77-855063290203-322, 326-475, 477-484, 486-497Cellular processes
ce030554450  000 35286-299, 322-335, 430-436100 Unknown
ce08568840  1900 0 235726768-83Transcription
ce08569830  000 0 4000 Unknown
ce085701140  000 0 4000 Unknown
ce085713560  000 12113-124487383515-355Cellular processes
ce235682154in20-37, 42-60, 70-89, 129-1474000 1324-36100 Unknown
ce185412160  0156126-1812455-66, 133-144100 Unknown
ce025322053out91-108, 149-166, 187-204000 0 800 Unknown
ce278197040  000 14689-7025100 Cell envelope
ce277425120  02146270-297, 310-42712730-39, 78-95, 272-300, 366-389, 398-426, 485-5012100 Unknown
ce175043620  3600 3616-26, 116-128, 234-245100 Cell envelope
ce175051360  1800 11720-136600 Unknown
ce175061690  000 1162-72468551643-166Other categories
ce175071300  000 1530-44100 Unknown
ce1750827610  000 30223-38, 310-315, 734-760, 912-926, 1420-1440, 1582-1618, 1636-1658, 1691-1712, 1778-1810, 1845-1858, 1867-1894, 1925-1936, 1943-1955, 1984-2004, 2049-206224223392334-2405, 2437-2447, 2451-2482, 2496-2517, 2549-2651, 2654-2708, 2712-2755Unknown
ce175093480  3300 106101-118, 127-140, 153-182, 188-210, 313-33361400 Unknown
ce292113290  000 0 404729920-318Cellular processes
ce069241170  000 1039-484100 Unknown
ce069252474in77-101, 106-123, 164-188, 193-210000 2485-96, 192-2031000 Unknown
ce174996240  000 4447-59, 97-111, 432-44760900 Unknown
ce248263328in20-37, 42-59, 66-85, 92-113, 133-150, 200-219, 251-269, 284-3015800 0 36800 Unknown
ce175033910  000 0 146919522-42, 44-72, 74-218Cellular processes
ce268804342out352-370, 393-410000 0 8900 Unknown
ce277432320  000 37160-173, 183-189, 213-2282900 Unknown
ce290312550  0169109-17735106-119, 124-144600 Energy metabolism
ce011823552in145-163, 179-197000 479-21, 286-309, 344-3534400 Transcription
ce011838920  000 5331-42, 280-290, 465-481, 844-856500 Unknown
ce290326500  000 30220-236, 282-2942494322321-353, 358-376, 378-437, 439-491, 493-649Translation
ce290337340  000 2924-40, 142-1531900 Unknown
ce011865700  000 5834-51, 78-102, 239-25320824648287-568Energy metabolism
ce011871920  000 67105-118, 123-163, 174-18513000 Replication
ce0118810210  000 180417-435, 581-598, 699-727, 776-806, 855-868, 909-940, 949-959, 967-983, 1012-1020400 Unknown
ce011891220  000 0 100 Unknown
ce030624830  000 100188-201, 229-244, 247-267, 286-302, 349-360, 393-41250314728-71, 74-94, 96-177Translation
ce030637310  000 109231-238, 279-298, 414-433, 489-507, 538-546, 658-670, 695-714700 Unknown
ce0857315770  01464419-101, 107-162, 178-205, 221-248, 306-354, 392-426, 452-479, 497-524, 692-726, 735-804, 808-860, 920-961, 1023-1078, 1115-1167105141-166, 338-354, 758-767, 1515-1538, 1547-15746732410684-685, 688-808, 810-833, 836-1009, 1014-1102Unknown
ce030583560  000 1426-44, 126-152, 155-171, 192-222, 228-237, 331-348100 Unknown
ce030591480  000 575-27, 37-59, 77-87100 Unknown
ce030602560  000 3054-69, 179-192100 Unknown
ce030612480  1800 157-21400 Unknown
ce041622260  000 12115-126700 Central intermediary metabolism
ce041631300  000 0 500 Transcription
ce041648650  3000 0 3500 Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce277448890  3000 0 3500 Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce041658940  0256516-543, 763-7902946-22, 67-78, 118-126, 500-525, 530-552, 610-622, 636-654, 662-682, 692-759, 764-783, 810-87530006144824-64, 67-473Replication
ce041661270  000 0 9841261-126Energy metabolism
ce041682270  1900 102114-129, 142-227500 Unknown
ce277455760  000 53248-262, 272-282, 284-298, 526-53731710170300-399, 412-423, 429-486Transcription
ce041704440  000 776-17, 33-44, 116-130, 140-150, 152-166, 394-40531611170168-267, 280-291, 297-354Transcription
ce277466420  000 64248-262, 272-282, 284-298, 526-537, 587-59731610170300-399, 412-423, 429-486Transcription
ce1567010430  1600 10617-34, 78-110, 117-146, 153-167, 535-54429270878164-1041Unknown
ce1567911171in1068-1085000 556-19, 105-109, 925-943, 1070-108684819851197-1047Unknown
ce156712830  4700 136110-124, 140-199, 205-225, 230-269625198126-196, 201-227Unknown
ce156722830  4700 136110-124, 140-199, 205-225, 230-26961300 Unknown
ce156733833in111-128, 298-322, 327-3512800 2218-26, 344-3561400 Unknown
ce156741160  000 2058-77100 Unknown
ce156751400  000 0 100 Central intermediary metabolism
ce156764114in7-24, 29-47, 88-108, 126-1431900 1851-68500 Unknown
ce156774350  000 0 1102121270-325, 327-335, 342-356, 359-399Energy metabolism
ce1567811810  000 5995-105, 418-442, 796-818400 Unknown
ce2356918090  2300 268-19, 988-10011900 Unknown
ce085747510  1800 76435-448, 545-555, 680-730298532055-213, 215-326, 332-380Unknown
ce085751210  000 495-30, 42-64200 Unknown
ce2921212658in55-73, 113-130, 195-219, 299-316, 745-762, 827-851, 928-945, 959-976000 6119-29, 627-636, 655-669, 701-712, 844-85630007112572-313, 315-372, 376-630, 686-734, 737-793, 796-1259Transport and binding proteins
ce269094110  000 1465-783000763104-182, 207-337Regulatory functions
ce0857810111out979-9971600 415-16, 656-669, 811-8257400 Unknown
ce085794490  000 101163-183, 369-448952822482-112, 114-140, 144-157, 192-287Unknown
ce235705363out280-301, 473-490, 495-5192000 68282-296, 375-381, 404-420, 503-5312571518949-237Unknown
ce235712540  000 3925-38, 69-82, 109-1192500372482-249Regulatory functions
ce258043971in379-3962100 36249-266, 379-3962100 Unknown
ce175104480  1900 9380-91, 239-248, 306-322, 350-366, 371-4072100 Transport and binding proteins
ce278203990  1800 59235-247, 279-288, 361-376, 378-3972100 Cell envelope
ce278212560  2500 9683-121, 135-191624197113-209Unknown
ce273664458out37-54, 71-89, 111-135, 159-176, 223-247, 301-321, 326-343, 348-365000 46302-316, 344-360, 395-408773330731-38, 40-64, 66-119, 123-152, 154-186, 193-205, 215-231, 236-271, 295-346, 350-388Unknown
ce085813250  000 0 100 Regulatory functions
ce085823320  1900 6534-62, 68-91, 260-271300 Unknown
ce0858354511out62-79, 96-113, 118-135, 158-175, 186-203, 309-326, 339-356, 369-386, 396-413, 438-455, 463-4802100 43311-327, 397-410, 428-439161724683-232, 235-300, 303-365, 398-462, 465-508Transport and binding proteins
ce053592906in22-40, 49-68, 82-106, 180-197, 209-227, 263-280000 12154-16567742689-148, 158-285Transport and binding proteins
ce053605741out535-5571800 20540-5596201231204-247, 250-259, 261-285, 297-325, 330-355, 360-374, 376-410, 413-459Cell envelope
ce0536159612in143-162, 206-223, 228-252, 257-277, 282-299, 317-334, 377-401, 418-435, 449-466, 479-496, 511-529, 546-5631800 13321-33323172349195-287, 292-330, 332-408, 412-439, 444-526, 532-553, 559-565Unknown
ce053624240  000 46313-338, 365-3841400 Unknown
ce053637852out190-214, 289-306000 1002-13, 31-72, 78-93, 296-310, 543-5573400 Unknown
ce053642732in19-41, 46-635300 1263-74100 Unknown
ce053655006in27-47, 61-83, 167-186, 227-251, 284-303, 329-353000 0 352328832-71, 73-100, 113-122, 135-188, 195-207, 213-232, 237-276, 279-296, 301-365Unknown
ce1568010780  000 52197-214, 216-231, 593-6101800 Unknown
ce053671410  000 1587-10115631291-54, 56-114, 116-131Unknown
ce278221920  000 0 482191541-154Fatty acid and phospholipid metabolism
ce292135440  000 0 200 Fatty acid and phospholipid metabolism
ce16901520  2100 413-19, 26-49300 Unknown
ce169021100  1900 123-14100 Unknown
ce169031510  000 0 11061393-131, 134-139, 146-149Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers
ce27824361unk19-36000 1018-27000 Unknown
ce27825840  1900 163-18100 Unknown
ce025342870  2100 84146-209, 213-232619197160-256Unknown
ce278269350  000 45710-742, 924-9351452157707180-200, 202-561, 576-588, 593-632, 659-931Unknown
ce278274700  0128376-40328123-140, 313-322200 Unknown
ce1854229620  01791189-1267247123-133, 142-174, 840-849, 1066-1083, 1115-1143, 1164-1185, 1187-1243, 1540-1552, 1588-1599, 2213-2224, 2841-2856, 2949-29629200 Regulatory functions
ce0858414833in32-49, 1209-1226, 1315-1332000 1427-4013511118453-61, 64-129, 131-145, 154-160, 168-195, 199-249, 264-282, 288-324, 326-330, 333-349, 368-569, 573-593, 595-629, 631-660, 664-674, 680-727, 734-741, 744-757, 760-780, 859-930, 932-947, 963-996, 1000-1079, 1081-1084, 1103-1117, 1120-1191, 1222-1426, 1432-1453, 1459-1478Cell envelope
ce030662551out134-155000 0 1000 Unknown
ce185432581out137-158000 0 1000 Unknown
ce185441950  000 0 18041011942-195Cell envelope
ce030685584out289-307, 321-338, 349-366, 508-5252500 599-21, 272-287, 334-347, 355-370526119435-96, 99-119, 148-183, 188-218, 240-268, 271-285Transport and binding proteins
ce0306912240  000 211073-10931200 Unknown
ce282083360  3000 278-22, 97-108300 Unknown
ce085861520  000 0 300 Unknown
ce08587590  000 0 100 Unknown
ce288981761in102-119000 17104-120800 Unknown
ce011912653in18-35, 59-79, 84-1083200 11254-26492799127-146, 148-174, 176-197, 204-233Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers
ce011921090  000 2178-984400 Unknown
ce011933650  000 0 20400 Unknown
ce011941420  000 0 100 Translation
ce278284190  1700 374-14, 203-217, 293-30311578539013-297, 309-322, 325-415Cell envelope
ce278294070  1700 5669-80, 202-210, 282-301, 340-35411358737920-294, 297-311, 314-359, 361-403Unknown
ce288991690  000 0 1500 Unknown
ce011963570  000 17226-2421600 Unknown
ce011972271out41-58000 569-20, 48-62, 115-126, 204-220100 Energy metabolism
ce011987330  000 17292-30816400 Unknown
ce011991900  000 0 1500 Unknown
ce012002870  000 0 655332816-286Energy metabolism
ce292144960  000 0 100 Unknown
ce264313590  000 0 100 Unknown
ce012022063out17-36, 52-75, 80-973100 3212-26, 188-204200 Unknown
ce012035490  000 0 100 Transcription
ce156813368in24-41, 65-83, 103-125, 139-158, 178-195, 200-217, 244-261, 266-289000 0 40600 Fatty acid and phospholipid metabolism
ce15682671in48-66000 0 300 Unknown
ce156832030  000 2127-35, 159-17011900 Unknown
ce156842712out25-42, 93-110000 0 1200 Unknown
ce283895630  000 3138-46, 364-3851300 Unknown
ce175234300  000 25388-4123000553905-394Regulatory functions
ce175242620  000 0 30001012594-262Regulatory functions
ce278301290  000 5438-66, 105-129100 Unknown
ce292157070  0128625-65253560-571, 609-618, 664-694300 Unknown
ce292164030  0128321-34853256-267, 305-314, 360-390200 Unknown
ce175164920  000 0 400 Unknown
ce175176840  000 28646-673300 Translation
ce1751812620  03120512-539, 547-574, 885-94814886-94, 852-877, 880-937, 939-952, 1167-1192, 1197-12111200 Energy metabolism
ce175194000  000 30360-389900 Unknown
ce175201710  000 0 200 Unknown
ce175212561out154-171000 0 200 Unknown
ce175223010  2329771-116, 138-18816819-48, 53-19018600 Unknown
ce030705100  2300 163-1821717747536-510Energy metabolism
ce03077380  000 0 100 Unknown
ce030715220  2300 193-2121608149823-55, 58-522Energy metabolism
ce278314840  000 17136-1526600 Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce030739541in58-75000 130235-250, 322-335, 355-422, 428-459700 Unknown
ce030745010  2600 193-2121728147031-500Energy metabolism
ce205405050  0128181-20847138-167, 321-3371131955-99Transcription
ce030766801in163-180000 35308-326, 566-5811335453597-104, 106-117, 119-223, 236-296, 298-363, 365-397, 400-498, 500-650Fatty acid and phospholipid metabolism
ce282098640  2500 103350-366, 435-482, 488-503, 556-5776596265332-383, 388-432, 674-829, 832-843Unknown
ce053773810  000 874-813000783772-378Regulatory functions
ce053783270  000 22209-230300 Translation
ce053796528out4-21, 233-250, 296-320, 325-342, 377-401, 418-435, 544-561, 568-5862200 553-30, 315-327, 639-6523100 Unknown
ce053693790  2500 0 6800 Unknown
ce053704020  000 0 5942697-75, 77-276Transcription
ce053712530  000 15235-249554662521-252Cellular processes
ce053724960  000 2964-78, 97-110226314314181-494Unknown
ce053731430  2000 0 100 Amino acid biosynthesis
ce053741890  000 0 360891851-185Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers
ce0537511291out116-1332100 31267-103, 119-139, 165-200, 203-212, 263-282, 311-346, 357-377, 453-470, 493-502, 517-529, 534-546, 613-630, 1026-1040, 1064-1082, 1104-1128100 Unknown
ce053766740  000 8817-28, 278-300, 328-340, 413-433, 435-446, 549-555900 Unknown
ce041724500  1500 0 300077336115-450Regulatory functions
ce041735310  000 14416-429300077358171-528Regulatory functions
ce04174970  4400 0 100 Unknown
ce258051491in10-272400 337-27, 56-67100 Unknown
ce2580611210  2100 48203-215, 297-308, 1030-1045, 1071-107732300 Unknown
ce2783211480  2100 48203-215, 297-308, 1057-1072, 1098-110432200 Unknown
ce041776706out95-112, 392-409, 433-450, 518-535, 548-565, 588-6052600 3070-90, 242-2501600 Unknown
ce041781170  1900 0 100 Unknown
ce235723287out18-42, 55-79, 107-126, 141-158, 180-198, 243-260, 278-2954000 1218-293200 Unknown
ce085993307out24-43, 55-74, 107-125, 143-160, 189-206, 247-265, 279-2963400 13250-2624200 Unknown
ce086003307out25-43, 51-71, 108-125, 146-163, 190-207, 249-266, 281-2984800 0 4300 Cellular processes
ce086012190  000 13158-1704400 Unknown
ce086023030  000 0 52300 Unknown
ce086032010  2000 0 4500 Unknown
ce086042030  2000 254-284500 Unknown
ce085913307out24-42, 55-79, 103-123, 142-161, 180-199, 249-270, 276-2944100 14157-1704000 Energy metabolism
ce085922254out17-34, 51-73, 98-122, 191-208000 0 4700 Amino acid biosynthesis
ce085932010  2000 154-184500 Unknown
ce085942040  2000 1451-644200 Unknown
ce292172004in25-44, 54-78, 104-127, 145-1633400 0 2600 Unknown
ce085963206out16-33, 44-68, 97-116, 131-148, 180-197, 234-2512400 154-184100 Unknown
ce085973207out16-33, 46-70, 95-113, 137-161, 181-198, 244-268, 273-2902400 0 3800 Unknown
ce085981783out40-57, 96-113, 126-143000 15159-1735700 Unknown
ce197208320  000 5857-70, 439-472, 769-778300 Unknown
ce197217470  000 49260-271, 278-289, 406-417, 497-50965215533-75, 80-92, 94-134, 136-161, 164-195Regulatory functions
ce197224100  000 0 29200 Unknown
ce197236710  000 201-201200 Cell envelope
ce197244840  000 9181-189200 Translation
ce267966180  0128589-616140385-402, 417-438, 446-464, 474-487, 496-505, 513-555, 600-613254934329-371Unknown
ce267976410  0128612-639140408-425, 440-461, 469-487, 497-510, 519-528, 536-578, 623-6362561034154-394Unknown
ce267982452in172-189, 224-241000 12226-2371200 Transcription
ce205452700  000 3681-96, 100-119144113420068-91, 95-270Unknown
ce205421700  000 182-1915051371683-170Unknown
ce009096540  000 25415-426, 597-6091500 Unknown
ce009102360  000 4016-35, 210-229200 Unknown
ce156864760  2300 39382-394, 417-4421100 Unknown
ce009125060  0128161-1881419-321100 Unknown
ce009134500  000 45135-153, 165-176, 436-449163964301-430Cellular processes
ce175263560  000 10513-28, 48-69, 89-100, 192-201, 228-238, 274-288, 326-344388358118-175Transcription
ce248282980  000 3038-50, 238-254144481108-126, 128-185, 188-191Unknown
ce248293952out53-71, 378-3953200 164-19164111233155-385Unknown
ce248304022in54-73, 385-4023200 304-19, 341-354164811036128-63, 65-368, 374-394Unknown
ce086093221out6-231900 14426-34, 38-80, 101-120, 142-163, 185-200, 225-242, 271-2861300 Unknown
ce053804184out39-56, 61-81, 86-104, 114-131000 104121-132, 162-2531014133278-284, 286-293, 298-314, 316-390, 392-417Unknown
ce248313895in34-51, 108-125, 192-209, 270-287, 292-309000 3134-49, 276-2904700 Unknown
ce053821590  000 0 500 Cell envelope
ce086103150  000 1263-65, 245-3071041112127-190, 198-211, 217-250Unknown
ce2774712390  0256506-533, 657-68460929-60, 279-301, 346-378, 402-436, 442-481, 494-535, 537-547, 557-568, 598-632, 640-652, 654-659, 662-774, 861-873, 891-904, 1026-1052, 1077-1221, 1224-12381200 Cell envelope
ce086124420  000 464-24, 36-45, 342-356533738455-438Energy metabolism
ce248325240  0128161-18845110-116, 155-19241011253225-381, 386-407, 413-460, 481-506Cellular processes
ce277487880  000 23112-26, 28-35, 57-85, 197-217, 337-351, 364-380, 513-519, 529-544, 567-588, 593-608, 627-640, 723-758, 764-778900 Unknown
ce086152610  000 1684-992500 Unknown
ce086161360  000 453-14, 63-83, 114-1258100 Translation
ce086173360  015484-13760105-116, 160-180, 228-242, 321-332200 Unknown
ce29218930  000 0 200 Unknown
ce175285124out32-49, 79-96, 233-250, 268-2855500 16387-4023800 Unknown
ce205461360  1900 1387-99100 Unknown
ce175291910  1800 33155-187200 Unknown
ce175301910  1800 33155-187200 Unknown
ce175314400  2000 12427-438100 Unknown
ce17532890  1800 486-17, 22-31, 60-85300 Unknown
ce175333361out103-120000 36110-121, 171-194100 Unknown
ce069264700  000 170189-201, 291-325, 330-374, 389-410, 412-4661500 Replication
ce069351230  000 146-19300 Unknown
ce069361614out26-43, 55-74, 99-118, 123-1404000 0 100 Energy metabolism
ce273674360  000 58164-173, 185-190, 371-383, 397-4257400 Translation
ce069282651in15-392512871-980 3200 Regulatory functions
ce069292870  000 8114-41, 104-1561100 Unknown
ce1753515580  1900 1013-12, 1210-1226, 1243-1263, 1327-1349, 1353-1367, 1429-144352268815730-760, 767-777, 785-1432, 1434-1558Unknown
ce1753621670  1900 1153-12, 1210-1226, 1243-1263, 1327-1349, 1353-1367, 1429-1443, 2092-2105515701411550-766, 772-815, 822-1971Unknown
ce069326013out65-85, 156-173, 495-512000 5566-94, 200-213, 500-51199522241223-240, 246-468Unknown
ce248333920  000 3010-21, 369-3862700 Unknown
ce273683130  000 0 100 Unknown
ce086203790  000 12277-2884034635919-377Energy metabolism
ce086212256in5-22, 41-59, 78-95, 110-127, 143-162, 171-1952600 0 1800 Transport and binding proteins
ce086222958in6-23, 35-52, 83-100, 115-136, 152-176, 181-205, 220-237, 254-2742100 0 1700 Unknown
ce086232570  000 12414-46, 48-59, 107-118, 123-140, 174-185, 203-23923352810240-141Transcription
ce086242780  000 43168-180, 205-23424774110322-124Transcription
ce278334010  000 9211-19, 148-155, 172-208, 218-238, 372-388225129617-112Replication
ce086253510  000 1575-89217343393-337, 341-344Unknown
ce086331080  1900 0 200 Unknown
ce086341060  1800 0 200 Unknown
ce086351381out108-126000 1281-92100 Unknown
ce278344140  000 0 421273103-123, 127-209, 211-237, 241-248, 254-260, 264-273, 284-297, 299-356, 358-402Central intermediary metabolism
ce278351320  000 0 300 Unknown
ce086263720  000 1426-3911845430649-354Unknown
ce086274442out79-96, 121-138000 12428-439116853303125-427Unknown
ce086282170  000 0 100 Unknown
ce278368120  24142467-50893145-159, 164-174, 189-211, 301-315, 473-486, 488-5022000 Unknown
ce086304570  000 0 1022343324-227, 229-457Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce086316570  000 4815-26, 162-171, 410-420, 542-55610923960429-605, 609-635Cellular processes
ce086325170  1400 6926-57, 168-180, 280-3031299159318-325, 327-372, 374-478Unknown
ce001043747out12-33, 51-69, 89-106, 128-145, 180-198, 231-248, 266-2832500 0 300073344-314, 320-335, 339-345Transport and binding proteins
ce0864749311out19-37, 88-105, 117-141, 178-195, 205-223, 270-294, 312-330, 354-378, 383-400, 407-424, 443-4603300 0 2611238384-176, 181-221, 223-233, 235-325, 329-340, 348-437, 439-483Transport and binding proteins
ce001063010  000 28103-114, 161-176200 Unknown
ce001075250  000 9495-503300 Unknown
ce2055013850  000 67374-384, 1318-1336, 1339-1360, 1371-13851200 Unknown
ce2055113910  000 67374-384, 1324-1342, 1345-1366, 1377-13911200 Unknown
ce086373637out29-53, 69-87, 96-120, 190-214, 235-254, 292-314, 329-3464400 412-14, 27-39, 234-2484200 Unknown
ce086383369out30-53, 61-78, 83-100, 111-135, 159-179, 184-202, 211-228, 259-282, 296-3135900 15201-2154300 Unknown
ce086393850  2000 5399-110, 120-141, 263-281200 Unknown
ce086403070  000 146-193000853017-307Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce205471650  000 0 11081582-73, 77-162Unknown
ce205482930  000 0 10982772-73, 78-201, 205-224, 227-266, 268-288Unknown
ce205491520  000 0 11381402-60, 64-83, 86-146Unknown
ce086431351out9-261800 2494-117100 Unknown
ce086446420  000 0 24000 Unknown
ce086451880  000 18163-180800 Unknown
ce086463980  000 3116-32, 357-37012548835135-121, 133-396Unknown
ce041791650  000 377-20, 25-47100 Unknown
ce156945851in100-120000 10151-16057558464122-585Central intermediary metabolism
ce156953280  2000 2439-62200 Unknown
ce156963386in32-54, 75-92, 110-130, 152-169, 198-215, 252-269000 0 2000 Cell envelope
ce156974560  2000 406-16, 84-97, 369-383700 Unknown
ce156986050  1800 15587-601100 Translation
ce175384622in6-23, 111-1282100 4017-30, 153-173, 438-442900 Unknown
ce009151441out112-1292100 1417-30700 Unknown
ce0091616950  01281125-11521441220-1234, 1260-1277, 1291-1308, 1421-1433, 1470-1483, 1498-1506, 1533-1548, 1589-1603, 1653-1666, 1669-16809300 Unknown
ce009175560  000 2694-106, 439-451200 Unknown
ce009188370  000 8233-43, 149-161, 184-198, 215-227, 542-555, 776-79133511350348-371, 376-383, 391-404, 407-461, 467-523, 604-781, 784-797Unknown
ce278372700  000 5614-24, 101-118, 124-150235326111159-269Transcription
ce009202791out78-95012899-1261458-71100 Transcription
ce009211900  000 132-1421011261882-189Cellular processes
ce009222140  000 0 7200 Unknown
ce197274040  000 0 25600 Unknown
ce197285930  0128337-3643945-58, 262-276, 461-470500 Unknown
ce1972914961in1278-12950294204-248, 262-310447-19, 1260-1276, 1366-13793200 Unknown
ce197303450  000 12300-31111100 Unknown
ce1973112131out778-7951900 35170-188, 650-6653425109836-932, 936-947Unknown
ce248346581out576-594000 60275-283, 327-338, 361-374, 573-59729200 Replication
ce248354050  000 0 25700 Unknown
ce248363440  000 12260-271800 Unknown
ce248376600  000 0 24900 Unknown
ce009238070  000 37488-500, 533-5562191219560-590, 593-698, 700-717, 720-722, 725-737, 740-762, 767-778, 780-792Unknown
ce009244192in31-48, 357-374000 0 8600 Unknown
ce021575836out49-66, 85-105, 111-135, 167-184, 232-249, 280-297000 1948-66700 Unknown
ce021584353out245-263, 272-289, 303-3222500 14274-287518119731-104, 106-115, 117-125, 128-151, 154-209, 212-225, 231-240Transport and binding proteins
ce030791880  017056-1250 100 Unknown
ce021591900  000 0 100 Unknown
ce021601050  012857-840 100 Unknown
ce235753087out24-41, 52-76, 102-120, 144-163, 186-203, 221-238, 271-2883800 33101-117, 147-1626100 Unknown
ce235761950  000 0 100 Unknown
ce235773246in12-30, 42-59, 91-113, 188-205, 236-253, 279-2963400 0 25300 Unknown
ce248383256in16-33, 38-58, 131-148, 191-208, 237-261, 279-2972800 0 21400 Unknown
ce235784092out25-42, 133-150000 0 600 Unknown
ce235792860  000 0 24700 Unknown
ce235803030  000 1260-7124600 Unknown
ce205574080  2100 0 11514209191-381, 383-400Unknown
ce235813500  000 12254-2657600 Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers
ce235822910  000 9198-20625200 Unknown
ce205553220  000 0 25000 Unknown
ce292193090  000 0 23400 Unknown
ce04180510  000 122-13100 Unknown
ce041812082in63-85, 105-122000 0 100 Unknown
ce271043020  000 0 91119019-85, 149-187, 190-254, 258-276Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce041831000  5900 0 100 Unknown
ce271051930  000 1189-99100 Unknown
ce041852405in48-72, 77-94, 109-133, 138-155, 173-192000 41122-141, 175-186, 225-233200 Cell envelope
ce0418611310  2000 137234-248, 254-273, 501-514, 577-593, 1047-1064, 1071-1087, 1092-1127951420537-569, 571-683, 685-687, 705-731, 735-737, 740-743, 746-750, 752-780, 800-805, 813-836, 840-910, 913-917, 919-964, 967-984, 987-1019Cell envelope
ce069374184out1-18, 145-162, 295-312, 366-3831800 14372-385100 Regulatory functions
ce069381600  000 18143-160100 Transcription
ce069392050  000 4911-27, 39-55, 190-2042639339444-137Transcription
ce069401430  000 734-40100 Unknown
ce069414577out28-48, 64-87, 102-121, 143-161, 195-212, 280-298, 323-3420128247-2741034-43300073563-229, 263-303, 307-394Transport and binding proteins
ce053842052in23-42, 129-1461900 146-19246215821-43, 45-121, 129-186Unknown
ce0539348810out47-64, 77-101, 106-123, 137-154, 168-185, 226-243, 281-298, 321-338, 343-363, 422-439000 15321-3352414231752-231, 233-307, 319-356, 360-383Unknown
ce205594050  013167-979368-122, 189-226500 Unknown
ce053954441out9-262100 8610-41, 113-126, 172-185, 303-328100 Unknown
ce053963540  000 0 408113412-342Replication
ce205604040  000 1656-711800 Transcription
ce053974020  000 1656-712100 Transcription
ce053852080  1700 0 261216719-101, 103-186Cell envelope
ce053863080  2500 9011-23, 99-109, 155-166, 178-193, 196-214, 222-24058400 Transport and binding proteins
ce053872090  1800 0 261217214-162, 165-187Unknown
ce053882090  1600 0 261217612-187Cell envelope
ce053892100  1600 0 261217612-101, 103-188Cell envelope
ce0539048510in60-77, 145-162, 167-191, 196-220, 225-243, 253-270, 311-330, 351-375, 401-420, 435-4532000 29258-273, 442-45441400 Unknown
ce278382480  1900 0 600 Unknown
ce053922760  2300 12684-101, 131-154, 159-177, 199-26355300 Unknown
ce169042991out271-288000 2138-46, 277-288100 Other categories
ce275817650  0263321-355, 371-3988037-80, 187-206, 694-709492291501-551, 553-592Unknown
ce169052050  000 12177-18818401011841-184Cell envelope
ce290876620  000 1537-513900 Regulatory functions
ce069423080  000 0 3000922983-300Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce069433914in210-227, 244-261, 281-298, 343-360000 1812-29100 Unknown
ce069442633out23-47, 61-81, 103-127000 14164-1772300 Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce258073258in15-32, 42-59, 64-81, 92-111, 129-146, 182-204, 236-257, 273-2922700 4894-112, 203-215, 271-28628600 Unknown
ce258083257out16-33, 40-64, 89-112, 128-145, 184-202, 236-256, 275-2923200 3597-112, 269-28732100 Unknown
ce193643210  000 17249-2659900 Unknown
ce27839710  1700 0 100 Unknown
ce193652270  000 16212-2271471835-80, 88-94Unknown
ce193662360  000 1472-851601685-35, 37-73Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce193672940  000 0 8300 Transport and binding proteins
ce193682850  000 12239-250515391928-187, 190-201Central intermediary metabolism
ce278402180  000 1276-871611895-42, 47-76, 79-99Unknown
ce193702200  000 1276-871731965-42, 47-75, 78-106Unknown
ce193712012in52-72, 144-161000 13142-1541400 Unknown
ce193724690  000 12453-4642100 Unknown
ce248393646out11-28, 82-99, 111-128, 166-183, 192-209, 232-2503400 1312-2420600 Regulatory functions
ce053995424out247-265, 280-297, 314-332, 516-5332600 38322-335, 351-364, 379-388529120323-32, 35-99, 102-110, 113-122, 124-156, 159-162, 165-186, 194-243Transport and binding proteins
ce054002040  1600 0 200 Unknown
ce05401710  000 1114-24100 Unknown
ce185467981out686-7031700 466-12, 194-204, 638-6656066458416-545, 551-604Transport and binding proteins
ce193732080  000 0 8900 Unknown
ce193744360  000 0 9600 Unknown
ce193754410  000 1747-639500 Energy metabolism
ce193761470  1800 0 300 Unknown
ce001093720  000 0 4511219553-85, 99-260Transcription
ce001102080  000 0 41772111-114, 116-132, 138-151, 153-189Unknown
ce001115040  0139424-4625540-48, 435-463, 487-5031200 Unknown
ce001122917out52-69, 85-102, 131-151, 158-175, 186-203, 220-237, 256-275000 19217-227, 280-2878500 Unknown
ce001131390  1500 0 5100 Unknown
ce001141620  000 0 1000 Unknown
ce271063670  1900 99-17911422681-252, 255-308Unknown
ce08649340  2000 0 000 Unknown
ce086502080  000 1817-34100 Unknown
ce086513741out10-272700 2684-93, 96-111100 Unknown
ce086523920  000 14357-370299263212-96, 102-327Unknown
ce271074090  000 6276-91, 238-265, 271-283, 377-381262945266107-254, 270-387Transcription
ce086543920  000 29156-169, 361-3753700 Unknown
ce086551040  000 0 2600 Transport and binding proteins
ce0418778299in581-598, 1337-1354, 1361-1378, 3261-3278, 4899-4916, 5881-5898, 6315-6332, 7424-7441, 7605-7622000 106534-548, 799-813, 3552-3566, 4405-4418, 4638-4650, 5015-5027, 5221-5241N/AN/AN/AN/AUnknown
ce266757650  0128415-4426947-70, 426-440, 474-485, 723-740300 Unknown
ce271084960  0128415-4425147-70, 426-440, 474-485300 Unknown
ce015163290  1600 12316-3272500 Unknown
ce015176165out306-323, 404-421, 427-444, 486-503, 524-5412200 563-18, 71-84, 251-264, 364-3756000 Unknown
ce015186230  000 67261-273, 349-364, 398-414, 483-50310600 Transport and binding proteins
ce015199832in6-23, 452-4692100 704-16, 340-356, 366-377, 758-770, 934-948300081342513-854Cellular processes
ce235858492in55-72, 664-681000 9063-76, 151-167, 322-335, 732-748, 758-771, 824-83715900 Transport and binding proteins
ce015213420  000 3368-100551146131-159, 166-189, 210-223, 226-241, 246-279, 283-292, 296-314Unknown
ce285414047out120-144, 165-182, 208-225, 241-265, 270-287, 303-320, 338-3551900 183-201000 Transport and binding proteins
ce054028100  000 47590-605, 704-721, 795-80712883475312-764Transcription
ce086583200  000 0 100 Unknown
ce292203650  0128232-2590 3700 Unknown
ce086605320  000 5911-22, 37-48, 121-126, 227-239, 244-259600 Unknown
ce086612970  000 2765-76, 172-186100 Unknown
ce278412380  000 223-18, 188-193200 Unknown
ce086638520  000 3572-91, 642-656800 Unknown
ce086646330  000 1597-111190124474-83, 88-259, 262-275, 279-292, 294-296, 300-330Unknown
ce278425032out132-149, 166-1832000 0 884203276-307, 313-358, 362-372, 374-405, 407-419, 427-452, 454-496Transcription
ce08656850  000 0 100 Unknown
ce2758291410out31-48, 289-313, 318-342, 399-416, 425-443, 503-520, 740-764, 769-786, 843-861, 866-8845800 34464-482, 613-62722900 Unknown
ce069462900  2100 0 100 Unknown
ce069474580  000 86286-305, 311-318, 366-423100 Unknown
ce069483030  000 39153-167, 199-222166121565-160Unknown
ce292214605out20-44, 63-83, 100-118, 146-163, 255-274000 31145-158, 378-3942337523223-169, 171-174, 176-180, 186-230, 235-265Unknown
ce156994900  2100 2625-38, 276-28721617846526-490Energy metabolism
ce235863237out21-40, 45-66, 71-88, 94-112, 133-151, 188-205, 251-268000 0 33100 Unknown
ce235873397out21-38, 76-100, 112-130, 153-170, 215-234, 271-288, 301-318000 1525-3927700 Unknown
ce157092156in8-28, 33-52, 113-131, 136-160, 166-183, 190-2092300 14173-18627700 Unknown
ce175392260  2100 124-15100 Transport and binding proteins
ce235883228in19-37, 55-72, 77-101, 106-123, 135-152, 187-211, 249-266, 282-299000 0 32600 Unknown
ce235893687out37-57, 62-81, 131-149, 166-183, 232-249, 281-305, 323-340000 0 281328038-62, 64-99, 103-124, 137-186, 191-199, 207-231, 235-271, 273-291, 294-326, 333-356Unknown
ce1570057311out47-64, 75-92, 137-154, 172-189, 229-253, 278-297, 312-329, 343-360, 405-422, 442-459, 507-524000 11257-267172227243-76, 78-105, 107-129, 142-191, 196-204, 212-236, 240-277, 279-295, 300-347Unknown
ce157013767out42-66, 71-88, 133-151, 167-185, 227-251, 280-299, 324-344000 3019-38, 258-267254330332-64, 66-100, 104-126, 139-188, 193-205, 213-233, 237-274, 276-294, 298-314, 320-373Cell envelope
ce157023892in287-304, 343-360000 0 11334726527-124, 185-313, 317-326, 328-355Cell envelope
ce235903972in104-121, 292-3101800 352-19, 182-1985900 Unknown
ce157044058out46-68, 78-95, 129-148, 161-181, 232-249, 274-291, 310-327, 353-375000 26161-172, 269-28215800 Transport and binding proteins
ce157054067in65-83, 133-150, 165-186, 228-252, 279-296, 318-342, 361-378000 5313-33, 245-257, 360-378292331719-64, 66-79, 83-108, 121-182, 189-207, 209-274, 276-293, 296-313, 320-367Unknown
ce157062976out65-89, 95-116, 137-154, 168-186, 191-211, 241-259000 0 26900 Unknown
ce086651970  000 11145-1552818238-63, 66-81, 83-122Unknown
ce278432070  000 11155-1652718248-73, 76-91, 93-132Transcription
ce086665870  0198151-2480 48219361215-575Transcription
ce086675530  000 42326-341, 402-413, 502-5153200 Transport and binding proteins
ce086684070  000 0 21300 Unknown
ce205616020  000 23447-457, 470-481283317514-71, 263-341, 343-355, 359-383Regulatory functions
ce175402190  1900 19326-37, 39-21910000 Unknown
ce086711560  000 0 100 Unknown
ce086722800  000 28140-154, 165-177100 Unknown
ce086736340  000 3563-73, 483-50616700 Unknown
ce086743730  000 578-23, 266-282, 349-3722000 Unknown
ce086753310  000 7311-23, 29-42, 159-169, 231-244, 311-3312000 Unknown
ce086763270  000 3911-23, 171-181, 196-2101800 Translation
ce086773210  000 3850-62, 165-175, 208-2212000 Unknown
ce086784730  1600 202-11, 216-22510808546111-423, 425-472Transport and binding proteins
ce169072927out23-41, 59-77, 105-122, 136-153, 161-178, 215-239, 254-271000 4923-34, 137-154, 214-2323300 Unknown
ce292223130  000 0 63500 Cellular processes
ce248406090  000 0 22916004-68, 73-351, 354-609Cellular processes
ce169181190  000 0 100 Unknown
ce269102820  000 288-19, 141-1564000 Unknown
ce269111100  000 0 2900 Translation
ce269123120  2000 0 700 Unknown
ce292233007out32-49, 59-76, 107-124, 179-196, 212-229, 234-251, 256-280000 0 13500 Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce169085820  000 4214-28, 193-198, 232-245, 571-5772381267146-207, 240-299, 334-368, 394-400, 431-473, 478-514, 536-558Unknown
ce169092040  000 29175-203100 Unknown
ce1691012590  000 12178-189900 Unknown
ce169113730  000 0 969343686-373Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce169122270  000 27144-170100 Replication
ce292247109in81-98, 150-169, 174-191, 197-214, 285-302, 307-324, 329-346, 366-384, 399-416000 37244-259, 396-41616800 Replication
ce1691454411out123-140, 150-167, 185-202, 221-238, 246-263, 298-315, 332-349, 365-382, 387-404, 428-445, 480-497000 6914-52, 481-495, 516-5305400 Unknown
ce269132670  000 0 100 Unknown
ce041892510  18142103-144757-18, 93-103, 166-209, 242-249200 Unknown
ce041992970  000 0 1714128128-136, 141-206, 216-224, 229-236, 251-283, 290-292Unknown
ce042012062in10-28, 165-1843600 0 100 Unknown
ce041905481in501-518000 11506-516604644678-474Unknown
ce041912550  2400 2931-591800 Unknown
ce248413448in17-35, 40-58, 95-112, 132-149, 179-196, 201-219, 252-271, 284-3033100 13267-27936000 Unknown
ce258093438out15-32, 44-62, 87-111, 132-149, 197-221, 253-272, 277-295, 300-3172900 13121-13338500 Unknown
ce041943390  014963-1113983-102, 164-1821096142189-330Unknown
ce0419613880  000 2664-78, 578-588728513511-11, 13-121, 128-177, 181-204, 206-236, 238-265, 267-418, 420-433, 435-572, 579-603, 613-656, 658-1382Transcription
ce248423508out17-34, 46-70, 95-119, 124-148, 202-226, 261-279, 284-303, 308-3253500 0 36600 Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce278442694in84-101, 112-136, 153-177, 205-222000 1459-72100 Cell envelope
ce0695016130  1500 793-17, 721-731, 1470-1487, 1492-1513, 1516-152818000 Cell envelope
ce042047550  000 14185-1983100 Purines, pyrimidines, nucleosides, and nucleotides
ce042052080  000 19162-1802241215922-158, 161-182Replication
ce069519070  1900 596-10, 61-93, 864-8845700 Cell envelope
ce042096861out622-63921135305-339118209-237, 498-516, 518-547, 558-580, 628-6445119432-125Transport and binding proteins
ce278456841out620-63721135305-339109209-237, 498-516, 518-538, 556-578, 626-64275813532-125, 586-599, 601-627Transport and binding proteins
ce015237760  039881-108, 269-310, 329-35666240-256, 390-401, 420-440, 637-652273126641-129, 133-238, 243-266, 270-311, 319-323Unknown
ce015244987out55-72, 96-120, 129-150, 174-191, 261-285, 322-340, 363-383000 0 3000741520-84, 86-204, 207-302, 308-442Transport and binding proteins
ce235914461out378-3972400 29383-396, 402-416100 Cell envelope
ce185473070  000 15279-29315200 Unknown
ce185481540  000 0 200 Unknown
ce185491520  000 2130-50200 Replication
ce185506207out306-323, 328-348, 353-371, 376-393, 398-415, 536-554, 559-576000 15606-62076200 Unknown
ce18551990  012855-820 100 Transport and binding proteins
ce185521040  000 0 4000 Unknown
ce235925800  0128236-263175113-155, 220-242, 250-296, 452-467, 486-511, 537-5563600 Cell envelope
ce086885180  000 7927-40, 45-55, 59-75, 147-169, 316-3293804362147-389, 391-509Unknown
ce086898020  000 80195-214, 374-387, 661-691, 770-784400 Cell envelope
ce086804450  000 43168-195, 422-4362100 Regulatory functions
ce0868115900  0287542-600, 1310-133730322-36, 216-229, 313-324, 357-386, 491-516, 518-540, 555-601, 720-725, 838-842, 1066-1079, 1104-1115, 1124-1144, 1208-1217, 1257-1273, 1433-148323100 Regulatory functions
ce086824530  000 2331-41, 172-18330002138638-423Translation
ce086833680  000 174-20452724943-59, 61-139, 143-177, 181-196, 210-227, 232-249, 259-262, 264-325Unknown

Page 7 of 41

1  2  3  4  5  6  7 8  9  10  11  12  13  14  15  16  17  18  19  20 
21  22  23  24  25  26  27  28  29  30  31  32  33  34  35  36  37  38  39  40 
41